'진화/분자진화학'에 해당되는 글 12건
- 2012/02/24 Barcoding Universal primer cocktail for fish DNA barcoding
- 2011/07/27 Specificatioin of Phylogenetic Interrelations between Skate-Rays and Sharks
- 2010/09/15 Global patterns and predictors of marine biodiversity across taxa
- 2010/05/26 Chapter7. Bayesian phylogenetic analysis usign MrBAYES
- 2009/11/05 Cladogenetic correlates of genomic expansions in the recent evolution of actinopterygiian fishes
- 2009/10/27 10장 Genetic Drift: Evolution at Random- 유전적 부동, 무작위적 진화 (2)
- 2009/04/15 진화학
- 2009/04/15 진화학 수업
- 2008/12/19 Protein evolution & Evolution of (βα)8 barrel enzyme
- 2008/06/17 chapter 3자료
- 2008/05/20 Chapter 6. Sequence alignment algorithms (1)
- 2008/05/20 Chapter 3- Molecular evolution and population genetics
- Barcoding Universal primer cocktail for fish DNA barcoding
- 진화/분자진화학
- 2012/02/24 13:13
- cocktail primer, COI, DNAbarcoding, fishbarcode, Universal primer
Natalia V. Ivanova, Tyler S. Zemlak, Robert H. Hanner and Paul D. N Hebert
Canadian Centre for DNA barcoding, Biodiversity Institute of Ontario, University of Guelph, Guelfph, Ontario, Canada N1G 2W1
primer cocktails.pptxM13 forward/reverse 프라이머를 각 universal primer에 tagging하니 sesquencing할 때도 좋고,
여러종의 다양한 primer를 한번에 증폭하기도 편하다. Good!!!
- Specificatioin of Phylogenetic Interrelations between Skate-Rays and Sharks
- 진화/분자진화학
- 2011/07/27 17:31
Specification of Phylogenetic Interrelations between skate-.pdfJournal Evolutionary Biochemistry and Physiology, 2006, Vol 42, No. 2, pp. 128-133
Comparative and ontogenic biochemistry
Specificatioin of Phylogenetic Interrelations between Skate-Rays and Sharks
Mine Dosay-Akbulut
Medical Biology and Genetics Department, Veterinary Faculty, Afyon Kocatepe University, Afyon, Turkey
- Global patterns and predictors of marine biodiversity across taxa
- 진화/분자진화학
- 2010/09/15 10:25
- Global Warming, Human impact, Marine biodiversity, sst, 지구온난화, 해수표면온도, 해양생물다양성
Derek P. Tittensor1, Camilo Mora1, Walter Jetz2, Heike K. Lotze1,
Daniel Ricard1, Edward Vanden Berghe3 & Boris Worm1
1: Department of Biology, Dalhousie University, 1355 Oxford Street, Halifax B3H 4J1, Canada.
2: Department of Ecology and Evolutionary Biology, Yale University, 165 Prospect Street,
New Haven, Connecticut 06520-8106, USA. 3Institute of Marine and Coastal Sciences, Rutgers University, New Brunswick, New Jersey 08901-8521, USA.
Nature letters, Vol 466,
Point: 해양생물다양성의 경우 SST 해수표면 온도와 유의한 관계에 있고, Habitat, Human impact도 영향을 받는다.
그러므로..
지구온난화를 방지하고, 인간의 영향이 바다에 덜 미칠 수 있도록 하자는 것.
- Chapter7. Bayesian phylogenetic analysis usign MrBAYES
- 진화/분자진화학
- 2010/05/26 13:31
- bayesian, Bayesian phylogenetics, Markov chain monte carlo, MCMC, MCMCMC, Metropolis coupling, Mrbayes, posterior probability, prior probability distribution
7. 1 Introduction
7.2 Bayesian phylogenetic inference
7.3 Markov chain Monte Carlo sampling
7.4 Burn-in, mixing and convergence
7.5 Metropolis coupling
7.6 Summarizing the results
7.7 An introduction to phylogenetic models
7.8 Bayesian model choice and model averaging
7.9 Prior probability distribution
영어발표 지못미;;;
- Cladogenetic correlates of genomic expansions in the recent evolution of actinopterygiian fishes
- 진화/분자진화학
- 2009/11/05 09:54
- C-value paradox, gene duplication, phylogeny, ray-finned fishes, speciation
Proceedings of The royal society B
(2006) 273, 33-38
Judith E. Mank1, and John C. Avise2
1. Department of Genetics, University of Georgia, Athens, GA 30602, USA
2. Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of California, Irvine, CA 92697, USA
Keyworlds: gene duplications; speciation; phylogeny; C-value paradox; ray-finned fishes
- 10장 Genetic Drift: Evolution at Random- 유전적 부동, 무작위적 진화
- 진화/분자진화학
- 2009/10/27 15:44
- 분자진화, 유전자 흐름, 유전적 부동, 유효집단, 중립이론, 창시자 효과
10.1 유전적 부동의 이론
-표본오차로서 유전적 부동
-합류
-대립유전자 빈도들의 무작위 변동
10.2 유전적 부동에 의한 진화
-유효집단 크기
-창시자 효과
-실제집단들에서 유전적 부동
10.3 분자진화의 중립 이론
-중립 이론의 원리
-종내 그리고 종간 변이
-종간의 비교가 중립 이론을 지지해주는가?
10.4 유전자 흐름과 유전적 부동
-유전자 계통수들 그리고 집단 역사
-현대 호모 사피엔스 기원을 다시 생각해보기
8.1 유전자와 유전체들
8.2 유전자 돌연변이들
돌연변이의 예
돌연변이의 표현형적 효과
적응성에 미치는 돌연변이의 효과
8.4 재조합과 변이
8.5 핵형의 변화
염색체 재배열
7장 생물다양성의 진화
7.1 분류학적 다양성의 변화추정
비율들
멸종의 원인들
멸종률의 감퇴
대멸종
기원과 다양화
환경적 변화의 역할
- Protein evolution & Evolution of (βα)8 barrel enzyme
- 진화/분자진화학
- 2008/12/19 22:34
- (βα)8 barrel enzyme, duplication and fusion, half (βα)8 barrel, histidine pathway, patchwork model, protein evolution, retragrade evolution
음 그랬던거 같다. 아무튼 구조생물학 전공이신 차선신 박사님(교수님)께 수업을 듣고
발표한 내용이다.
책 일부에서 다룬 단백질 진화와 enzyme 중에 많은 수를 차지하는 (βα)8 barrel형태를 가진 애들의 진화를 다룬 것.
많은 것을 배우고 느낄 수 있었던 수업이었다.
Publish or Perish!...항상 명심하고 입으로 논문쓰지 말지어다!... 아하하하하하하하하.
- chapter 3자료
- 진화/분자진화학
- 2008/06/17 15:05
chapter3-1.ppt- Chapter 6. Sequence alignment algorithms
- 진화/분자진화학
- 2008/05/20 15:40
- algorithm, dynamic programming, gap cost functions, global alignment, heuristic algorithms, local alignment, multiple sequence alignment, progressive alignment, T-coffee
Chapter 6.
6.1 what is an algorithm?
6.2 Pairwise sequence alignment - the problem
6.3 Pairwise sequence alignment - dynamic programming method
- 6.3.1 Algorithm 1 - Global alignment with linear gap penalty
- 6.3.2 Algorithm 2 - Local alignment with linear gap penalty
- 6.3.3 Algorithm 3 - General gap penalty
- 6.3.4 Algorithm 4 - Affine gap penalty
6.4 The effect of scoring parameters on the alignment
6.5 Multiple sequence alignemtn
- 6.5.1 The progressive alignment method
- 6.5.2 Improving progressive alignment
- 6.5.3 Recent developements in multiple sequence alignment
- Chapter 3- Molecular evolution and population genetics
- 진화/분자진화학
- 2008/05/20 15:26
- adaptationist, coalescence theory, molecular evolution, natural selection, neutralist, population genetics, random drift
출판사에 문의해보니 번역을 올리는 것은 안된다고 했다.
그래서 내가 발표한 chapter만.
뒤로 갈 수록 통계/수학적인 의미에 두통이 -.-
결국 슬라이드도 깨끗하다는...
수식을 다 슬라이드에 적어두는 것이 좋지만. 일단은..
Chapter 3.
3.1 What is evolution?
3.2 Mutations
3.3 Sequence variation within and between species
3.4 Genealogical Trees and Coalescence
3.5 The spread of New mutations
- 3.5.1 Fixation of neutral mutations
- 3.5.2 Simulation of random drift and fixation
3.6 Neutral evolution and adaptation
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